Ghost in the Shell - Arise

2027. Un an après la fin de la IVe Guerre Mondiale.
Un attentat à la bombe tue un marchand d'armes qui avait des liens avec la mystérieuse Organisation 501.

Pour enquêter, la Sécurité Publique engage Motoko Kusanagi, une cyborg spécialisée dans le hacking.
On lui adjoint les services de Batou (qui la considère comme une criminelle), Togusa (inspecteur en charge de meurtres de prostituées qui pourraient avoir un lien avec l'attentat) et Kutz (membre de l'Organisation 501).
Tous les quatre se lancent sur les traces d'un virus nommé Fire Starter.